Platinum Bio Inc.(所在地:广岛县东广岛市,CEO:奥原启辅,以下简称「本公司」)荣幸地宣布,其题为「工作流程:为特定基因组学问题微调和评估 DNA 语言模型」的协议论文,该论文总结了使用 DNA 语言模型应对特定基因组学挑战的 AI 创建协议,已于 2026 年 4 月 3 日在生命科学协议专业期刊「Bio-protocol」(ISSN:2331-8325)在线发表(经过同行评审)。本文献由广岛大学设立的 Platinum Bio 联合研究讲座生物 DX 研究室撰写,作者包括本公司研发部生物 DX 团队的首席研究员中前和恭,以及首席科学官(CSO)坊农秀雅。 DNA 语言模型是一种人工智能(AI)类型,它像学习语言规则一样,从由 A、T、G、C 组成的海量 DNA 串行中进行学习。在本协议中,我们以可再现的方式,逐步展示了对 DNABERT-2(DNA 语言模型的代表性范例)进行额外训练(微调)并评估其针对特定研究目的性能的步骤。该协议能够构建出能够从 DNA 串行中读取有意义特征的 AI 模型,而无需仅仅依赖专家直觉或个人专业知识。 在论文中,我们通过微调 DNABERT-2,对基因编辑中存在问题的「非预期 RNA 影响(RNA 脱靶)」进行了预测。此外,通过类似的微调方法,我们还对从基因信息生成担生命功能的蛋白质所需的启动子串行进行了预测。我们认为,这类可再现的协议可以为生命科学研究人员预测各种基因组学挑战并找到解决方案提供基础。 此外,在微调过程中,我们使用了日本企业 Sakura Internet Inc. 提供的 VM 型 GPU 云端服务「高火力 VRT」。论文指出,虽然在此环境下通常一天左右即可完成微调处理,但使用五张其他 GPU 的配置则需要约 3-7 天,这表明高性能 GPU 云端显著影响研究开发的速度。利用国内云端基础设施进行高速 AI 研究也是本次成果之一。 出处:Nakamae, K. and Bono, H. (2026). Workflow for Fine-Tuning and Evaluating DNA Language Models for Specific Genomics Issues. Bio-protocol 16(9): e5676. DOI: 10.21769/BioProtoc.5676. 本公司以「以生物技术开拓未来」为愿景,以「通过设计生物功能来解决社会课题」为使命,正在推广基因编辑与生物 DX 平台。本次文献公开,展示了本公司结合 AI、基因组数据与计算基础设施,并将其转化为研究现场实际可用形式的努力。未来,本公司将继续在创药医疗、食品农业科技、环境能源等领域,推进 AI 应用基因组分析和基因编辑的社会实施。 ■ 文献信息 论文标题:Workflow for Fine-Tuning and Evaluating DNA Language Models for Specific Genomics Issues 刊登处:Bio-protocol 论文链接:https://doi.org/10.21769/BioProtoc.5676 ■ 关于 Platinum Bio Inc. 本公司是一家旨在将广岛大学最尖端的生物技术社会化的初创企业。利用我们独特的生物 DX 技术和基因编辑技术,我们作为能够设计解决全球社会课题的生物功能的平台提供者,正与各业务合作伙伴推进共创项目。 所在地:广岛县东广岛市镜山三丁目 10 番 23 号 成立时间:2019 年 8 月 30 日 代表者:代表取缔役 CEO 奥原启辅 事业内容:通过生物 DX 与基因编辑技术支持数据驱动式育种。