作为NEDO委托事业「加速实现碳循环的生物来源产品生产技术开发」(以下简称本事业)的一部分,独立行政法人产品评价技术基盘机构(NITE)近日开发并激活了「微生物选定支持工具」(以下简称本数据库),这是一个可根据微生物特性信息,从全球主要数据库中公开的微生物种类中,横向搜索具有特定特性微生物的数据库。 本数据库从公开的五个国际主要数据库中收录的约67000笔微生物菌株信息中,收集了培养温度、培养pH值、氧气需求等7种关于微生物的重要特性信息,并将其按微生物种类进行整理和集成。这是一个能够通过特性信息以日文横向搜索微生物种类的集成数据库。这是国内首次开发出可通过特性信息搜索微生物种类的集成数据库。 以往,研究人员必须在个别数据库中逐一查看数据来搜索微生物,但通过本数据库,在日本试图建构智能细胞的研究人员,将能更容易地搜索具有其感兴趣特性的微生物。未来,我们将根据用户的需求扩充功能。 1.背景 在生物制造领域,为了解决从原料到最终产品的瓶颈,积极利用人工最大化提高物质生产能力的生物细胞「智能细胞」的趋势日益活跃。由于智能细胞的开发耗时费力,因此在起始阶段,有效选定适合所需物质和生产条件的微生物至关重要。然而,以往培养温度、培养pH值、氧气需求等特性信息分散在多个数据库中,研究人员需要逐一查看个别数据库的数据来搜索和选定微生物,这对研究人员来说是一个沉重的负担。 在此背景下,NEDO自2020年度起通过本事业※1,致力于扩充用于创建工业智能细胞的生物资源,并开发其探索的基础技术。作为其中一环,NEDO正与NITE合作,开发一个能提高微生物探索效率的数据库。 2.本次成果 (1)微生物选定支持工具的开发 从NBRC※2在线目录(收录约21000笔菌株信息)、JCM在线目录(约9000笔)、JGI GOLD(约14000笔)、BV-BRC(约14000笔)、TEMPURA(约9000笔)等多个数据库中收录的约67000笔微生物菌株信息中,收集培养温度、培养pH值、氧气需求等7种特性信息,并按微生物种类进行整理和集成,从而建构了一个支持以日文选定微生物和检讨培养条件的数据库。这是国内首次※3开发出可通过特性信息搜索微生物种类的集成数据库。 此外,对于培养温度和培养pH值,除了以长条图显示分布外,还即时显示搜索结果的数量,从而实现更可视化的探索。 通过利用本数据库,可以有效地调查具有特定性质(如培养温度、培养pH值、氧气需求、嗜盐性等)的微生物。 (2)微生物选定支持工具的公开 本次开发的本数据库已于2026年2月在NITE营运的生物资源数据平台(DBRP)上公开。 ・本数据库 https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/trait-search/ ・生物资源数据平台(DBRP) https://www.nite.go.jp/nbrc/dbrp/top 3.未来计划 通过本数据库,国内试图建构智能细胞的研究人员将能从全球主要数据库中横向搜索具有其感兴趣特性的微生物。未来,NEDO和NITE将根据用户的需求扩充功能。 【注释】 ※1 本事业 事业名称:加速实现碳循环的生物来源产品生产技术开发 事业期间:2020年度~2026年度 事业概要:加速实现碳循环的生物来源产品生产技术开发 https://www.nedo.go.jp/activities/ZZJP_100170.html ※2 NBRC NITE Biological Resource Center的缩写,指NITE营运的生物资源中心(BRC)。 ※3 国内首次 截至2026年3月,根据NITE的调查。