日菲在5月28日峰会后宣布启动专属经济区（EEZ）及大陆礁层海洋边界谈判，引发北京强烈不满。中国海警局1日宣布，在台湾以东海域展开执法巡查。淡江大学学者揭仲分析，北京正通过此事件强化巡查强度，进行对台法律战，主张「两岸一中」。国防院研究员苏紫云则认为，北京试图借此彰显对台周边水域的治权。面对北京的蚕食鲸吞，学者建议台湾应与日、菲交涉，捍卫自身权益。外交部发言人萧光伟表示，考量日菲谈判划界海域与台湾EEZ高度重叠，将向日菲表达应考量此事实，不应排除或损及台湾权益，并应与台湾协商。